目的:通过基于大数据库的生物信息学分析,寻找皮肤T细胞淋巴瘤(CTCL)治疗新方法。方法:通过重新质控并整合分析CTCL细胞经罗米地辛处理前、后的基因表达谱(GSE110248),筛选差异表达基因,通过DAVID数据库进行GO分析和KEGG信号通路富集;将差异基因导入Connectivity Map(CMap)数据库获得可对差异基因产生作用的药物分子,结合SubpathwayMiner软件包对CMap数据库中药物分子作用数据进行通路分析的结果筛选药物分子作用通路;利用STRING和Cytoscape 3. 5. 1构建蛋白-蛋白对接通路网络和药物-蛋白对接通路网络;利用Sybyl X-2. 1. 1进行分子对接验证候选药物与核心差异基因相互作用关系。结果:对GSE110248整合分析共获得630个差异表达基因,通过对差异基因富集后得到的12个CTCL相关KEGG通路和33个CMap数据库药物分子作用通路取交集,得到2条重叠通路和CMap数据库中14种作用于这2条通路的药物;通过绘制2个重叠通路中差异基因表达蛋白分子的PPI网络,确定WNT3为核心基因;最后,通过分子对接验证结果,筛选出茴香霉素、伊立替康、舒洛地尔、米安色林、罗格列酮、甲氟喹和屈氟尿苷为CTCL最具潜力的候选治疗药物。结论:生物信息学分析揭示CTCL药物治疗的分子机制,并为CTCL的抗肿瘤治疗提供新的思路。
广西医科大学学报目录
SIRT1过表达介导PPARγ-PGC1α-NRF2通路对肥胖症大鼠肝脏脂肪沉积和变性及氧化应激的调节作用(英文)
兰天 刘巍梦 邹阳 邱平委陵菜积雪草酸通过促进肝细胞自噬改善LPS/D-GalN所致的小鼠急性肝损伤
庞小红 乔倩 Vonglorkham Sayyaphone 庞丽君 冯钟文 陈思韵 韦锦斌龙蛭汤对大鼠局灶性脑缺血再灌注损伤的保护作用
李南方 陈永斌 刘启华 黄显雯 罗艳萍 范俊逸微血管病变在小鼠口腔黏膜下纤维化和口腔癌病变过程中比较研究
温琦涛 王涛 于大海 孙莹 郭梦竹 施强秋水仙碱治疗肝纤维化的网络药理学研究
章波 麦琬婷 檀燕君 黄秋洁 叶勇18F-FDGPET/CT评估恩度治疗鼻咽癌移植瘤模型的疗效研究
黄晓新 刘露 莫纯威 刘勤敏 金观桥Ligase4缺失对芹菜素抑制TK6细胞增殖作用的影响
赵梓潞 向翠方 冯晓雨 卿勇异牡荆素对硫代乙酰胺诱导的小鼠急性肝损伤的保护作用及其机制
乔倩 雅凤 庞小红 庞丽君 冯钟文 陈思韵 韦锦斌miR-21调控PI3K/Akt信号通路诱导宫颈癌细胞凋亡的机制研究
莫羽 吴菲远 马天仲 吴小容饥饿条件下敲低SphK1通过调控自噬抑制结肠癌细胞的增殖
林兰 朱丽叶 罗世波 吴江妮 刘诗权迷迭香酸对肝癌荷瘤小鼠的抑瘤作用及诱导凋亡机制研究
曹雯 韦斯军 张文娟 莫凯 蒋伟哲松果菊苷对脂多糖诱导的骨关节炎软骨细胞增殖及炎性特征的影响
庞运芬 雷丹青基于网络药理学的蟾毒灵抗鼻咽癌作用机制研究
杨建宇 吕安乔 成南南 杨萌哲 黄元姣 肖曼琪 唐剑琼醉茄素A对小鼠脊髓损伤的抗炎和神经保护作用研究
侯秦汉 刘全 付锦龙 何娟 闫宪磊基于大数据库寻找皮肤T细胞淋巴瘤潜在治疗药物
陈欣 谢祖成 罗彬 杨柳 农雅丹 李丝竹 彭志刚巨噬细胞极化在七氟烷致大鼠认知功能障碍中的作用
刘辉梅 庾俊雄 陈芳维生素D和心房颤动因果关系的孟德尔随机化研究(英文)
温政 李明丽 莫曾南SCN1A基因突变相关部分性癫痫伴热性惊厥附加症的基因型和表型分析
周喜靖 余璐 姚焰坤 官诗萍 石奕武 廖卫平miR-191-5p作为鼻咽癌外周血miRNA检测内源性参照的可行性及稳定性分析
孙丽纳 王昊 蒋旭 姚茜 刘琦 张莹 林国豪 韦正波 谢莹不良妊娠结局的危险因素及血清中抗核抗体和抗心磷脂抗体检测的临床意义
余倩 王露 王文 李丽Gasdermin D蛋白在稽留流产患者绒毛组织中的表达及其意义
秦志平 李慕军 曾雅畅慢性乙型肝炎患者肝纤维化不同阶段DJ-1蛋白的表达与临床相关性研究
张彪 玉艳红 成秋宸 吕自力 管燕芳局部晚期宫颈鳞癌淋巴结转移规律及预后评价
杨海艳 马艳群 方梓羽心率变异性对急性心肌梗死患者心脏自主功能的评价作用
董宁 崔海玲右美托咪定预处理对小儿急性化脓性阑尾炎术中血流动力学及术后氧化应激的影响
赵江河 李筱颖 李立 朱珊珊乳腺癌剪切波弹性模量硬度平均值在其分子亚型及病理特征中的差异
李程 梁键锋 曾福强 陈湘磁共振征象与肝癌术后早期复发的相关性分析
王鹏 阳君 赵阳 邓文娟 陆一昕 李印 叶甲舟 罗宁斌
期刊名称:广西医科大学学报
期刊人气:4816
主管单位:广西医科大学
主办单位:广西医科大学
出版地方:广西
专业分类:医学
国际刊号:1005-930X
国内刊号:45-1211/R
邮发代号:48-178
创刊时间:1971年
发行周期:月刊
期刊开本:大16开
见刊时间:4-6个月
影响因子:0.000
影响因子:0.000
影响因子:1.116
影响因子:1.988
影响因子:0.942
您的论文已提交,我们会尽快联系您,请耐心等待!
你的密码已发送到您的邮箱,请查看!