摘要:目的:检测翻译控制肿瘤蛋白1(TPT1)在肾细胞癌(RCC)中的表达,并探讨其在RCC中的作用。方法 从基因表达综合数据库下载微阵列数据集GSE15641(包括23例正常肾脏组织样本数据和32例RCC组织样本数据),并使用R 4.3.0软件筛选RCC组织和正常肾脏组织之间的差异表达基因。采用qPCR和蛋白质印迹法检测90例在南通大学附属医院确诊并接受治疗的RCC患者的RCC组织和癌旁正常组织,以及人RCC细胞(769-P、786-O、ACHN和Caki-1)和人正常胚肾293细胞(HEK293)中TPT1的表达。通过χ2检验分析TPT1表达与RCC患者临床病理特征之间的关系。从癌症基因组图谱数据库获得522例RCC患者的临床信息,采用ROC曲线和Kaplan-Meier生存曲线分析TPT1表达与患者预后的相关性。体外转染TPT1 siRNA和siRNA阴性对照(NC)至786-O和Caki-1细胞后,采用qPCR和蛋白质印迹法检测细胞中TPT1的表达,分别应用CCK-8实验、划痕实验和Transwell实验检测细胞的增殖、迁移和侵袭能力,并采用蛋白质印迹法检测凋亡相关蛋白的表达。结果 与正常肾脏组织和HEK293细胞相比,TPT1在RCC组织和RCC细胞中的表达均上调(均P<0.05)。TPT1表达水平低的RCC患者肿瘤大小及转移发生率均低于TPT1表达水平高的患者(均P<0.05)。ROC曲线分析结果提示,TPT1对RCC具有较高的诊断价值(AUC=0.856 9,95% CI 0.804 5~0.909 3,P<0.001)。Kaplan-Meier生存曲线分析结果显示,低TPT1表达组RCC患者的总生存期长于高TPT1表达组(P=0.018 4)。在细胞实验中,与siRNA NC组相比,转染TPT1 siRNA后786-O和Caki-1细胞的增殖活性、划痕愈合率和侵袭穿膜细胞数均下降(均P<0.01),凋亡相关蛋白Bcl-2和基质金属蛋白酶9表达降低、Bcl-2相关X蛋白表达增加(均P<0.05)。结论 TPT1参与了RCC的进展,可能是RCC治疗的潜在靶点。
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肾细胞癌(renal cell carcinoma,RCC)是起源于肾实质上皮系统的恶性肿瘤[1-2]。RCC在组织学上分为多种亚型,其中以透明细胞RCC最为常见[3-4]。RCC具有高复发率和高转移率等特点,给社会和患者家庭带来了巨大的负担[4]。RCC的治疗方法主要有手术、放疗和化疗,但多数患者起病隐匿、症状出现较晚,给治疗带来很大困难[5]。我国国家癌症中心发布的中国恶性肿瘤疾病负担报告显示,2022年我国有7.37万例新发RCC病例,有2.4万例患者因RCC死亡[6]。约30%的RCC患者在肿瘤切除后会发生远处转移,5年生存率低于20%[7-8]。因此,寻找RCC早期诊断和预后评估的分子指标是及早治疗、提高患者生存率的重要方法之一。
翻译控制肿瘤蛋白1(translationally-controlled tumor protein 1,TPT1)是一种高度保守的蛋白质,在多种人类肿瘤中异常表达,参与肿瘤细胞增殖、侵袭和凋亡的调控[9-11]。例如,miRNA-216a-5p通过靶向TPT1/哺乳动物雷帕霉素靶蛋白1轴抑制胰腺癌的进展[12];lncRNA TPT1-反义RNA1通过上调TPT1表达促进上皮性卵巢癌的发生[13]。然而,TPT1在RCC中的作用在很大程度上仍不清楚。
本研究探讨了TPT1在RCC组织中的表达水平及其临床意义,还通过功能缺失实验验证了TPT1在人RCC细胞中的生物学功能,旨在为RCC的诊断和治疗提供新的策略。
1、材料和方法
1.1 差异表达基因的筛选
从基因表达综合数据库(Gene Expression Omnibus,GEO)下载微阵列数据集GSE15641(包括23例正常肾脏组织样本数据和32例RCC组织样本数据),用R 4.3.0软件的preprocessCore包和limma包分别进行数据标准化处理和去除批次效应。采用箱线图评估数据标准化情况,通过主成分分析(principal component analysis,PCA)方法评估数据批次效应情况。使用R 4.3.0软件的limma包分析TPT1的差异表达情况,筛选条件为P<0.05且|log2(FC)|>1(FC为差异倍数)。
1.2 RCC患者数据下载及分组
从癌症基因组图谱(The Cancer Genome Atlas,TCGA)数据库下载RCC患者的临床信息和TPT1表达数据,共获得522例RCC患者数据。按照TPT1表达中位数(1.495)将患者分为TPT1高表达组(TPT1表达水平≥1.495)和TPT1低表达组(TPT1表达水平<1.495),每组261例。采用在线工具OncoLnc进行数据分析。
1.3 实验试剂
RCC细胞(人肾细胞腺癌细胞769-P、人肾透明细胞腺癌细胞786-O、人肾细胞腺癌细胞ACHN和人肾透明细胞癌皮肤转移细胞Caki-1)和人正常胚肾293细胞(HEK293)均购自美国ATCC。TPT1抑制剂(TPT1 siRNA-1、TPT1 siRNA-2)、siRNA阴性对照(negative control,NC)购自上海吉玛生物科技有限公司;转染试剂Lipofectamine®2000、TRIzol试剂、MaximaTMSYBR Green qPCR预混液均购自美国ThermoFisher Scientific公司。RPMI 1640培养基(适用769-P、786-O细胞)、DMEM(适用ACHN、HEK293细胞)、McCoy’s 5a培养基(适用Caki-1细胞)、FBS及胰蛋白酶购自美国Gibco公司;青霉素-链霉素混合溶液购自美国Sigma公司;PrimeScriptTM反转录试剂盒购自大连宝生物工程有限公司;GAPDH、TPT1、Bcl-2、Bcl-2相关X蛋白(Bcl-2associated X protein,Bax)和基质金属蛋白酶9(matrix metalloproteinase-9,MMP9)抗体及HRP标记的二抗均购自英国Abcam公司;CCK-8购自上海碧云天生物技术有限公司。
1.4 组织样本的获取
取2013年9月至2022年1月在南通大学附属医院确诊并接受治疗的90例RCC患者的RCC组织及癌旁正常组织(距离肿瘤病灶2 cm),保存在-80 ℃备用。本研究通过南通大学附属医院伦理委员会审批(2022-K138-01)。
1.5 细胞培养和转染
RCC细胞和HEK293细胞用含有10% FBS及100 U/mL青霉素-链霉素的培养基于37 ℃ 5% CO2恒温培养箱中培养,待细胞密度达约80%时用0.25%胰蛋白酶消化传代。将细胞接种于6孔板内,待细胞密度达50%~60%时更换成无血清培养基,分别将TPT1 siRNA-1、TPT1 siRNA-2和siRNA NC转染到细胞中,同时设置空白对照。TPT1 siRNA-1正义链序列为5'-UGUUCAAGGUCUAUCAGUGGA-3',反义链序列为5'-CACUGAUAGACCUUGAACAAU-3';TPT1 siRNA-2正义链序列为5'-AUUGUUCAA-GGUCUAUCAGUG-3',反义链序列为5'-CUGA-UAGACCUUGAACAAUUU-3';siRNA NC正义链序列为5'-GACUUCAUAAGGCGCAUGCUU-3',反义链序列为5'-GCAUGCGCCUUAUGAAGUC-UU-3'。
1.6 qPCR实验
使用TRIzol试剂分别从RCC组织和细胞中提取总RNA,用PrimeScriptTM反转录试剂盒将RNA反转录为cDNA,以GAPDH作为内参,采用MaximaTMSYBR Green qPCR预混液进行PCR扩增。反应体系:2×qPCR预混液12.5 μL、7.5 μmol/L正义和反义引物各1.0 μL、cDNA 2.5 μL、ddH2O 8.0 μL。反应条件:95 ℃ 15 min;94 ℃ 15 s(变性)、55 ℃ 30 s(退火)、70 ℃ 30 s(延伸),共40个循环。TPT1正向引物序列为5'-AGCC-ACAGTGAGATGTTCTCT-3',反向引物序列为5'-CAGCCCGTCTGCAATTTCCT-3';GAPDH正向引物序列为5'-TGTGGGCATCAATGGATTT-GG-3',反向引物序列为5'-ACACCATGTATTCCG-GGTCAAT-3'。采用2-∆∆Ct法进行半定量分析。
1.7 蛋白质印迹法分析
细胞转染后,向每孔细胞中加入蛋白质裂解液提取总蛋白质,并经沸水煮10 min变性。蛋白质样品通过SDS-PAGE分离后转移至PVDF膜,用5%牛血清白蛋白溶液封闭2 h,用TBST洗PVDF膜3次后过夜孵育一抗(稀释比例均为1∶1 000),然后用TBST洗涤PVDF膜3次后室温孵育相应二抗(稀释比例均为1∶5 000)。于避光环境中进行ECL显影并拍照,利用ImageJ软件进行光密度分析,最终结果表示为目的蛋白质条带与内参条带的光密度比值。
1.8 CCK-8检测
将转染后的细胞按照每孔1×104个的密度接种到96孔板中培养,在0、24、48、72 h时分别取样并加入CCK-8试剂,继续培养4 h,使用酶标仪测定波长450 nm处的光密度值。
1.9 划痕实验
细胞常规培养至形成单层细胞,用灭菌的100 μL黄色Tip枪头划一条直线,形成无细胞生长区域(即划痕),并记录划痕区面积。随后将细胞置于恒温培养箱中培养,分别在0、24 h时用PBS洗去划落的细胞,于倒置显微镜下观察并拍照。
1.10 Transwell实验
将100 μL的Matrigel稀释液均匀涂于Transwell包被小室底部基底膜,往小室外加入含10% FBS的培养基900 μL,每个小室内接种细胞数约为1×105个,常规培养24 h。取出Transwell小室,用PBS洗涤,加入4%多聚甲醛溶液固定。然后用结晶紫染液染色,在光学显微镜下观察、拍照,每组随机选取5个视野计数细胞。
1.11 统计学处理
采用SPSS 20.0软件进行统计学分析。计量资料若呈正态分布以
±s表示,两组间比较采用独立样本t检验,多组间比较采用单因素方差分析;若呈偏态分布则以中位数表示,两组间比较采用Wilcoxon秩和检验。计数资料以例数和百分数表示,组间比较采用χ2检验。应用在线工具OncoLnc,采用ROC曲线分析TPT1在RCC诊断中的价值,采用Kaplan-Meier生存曲线分析TPT1在RCC预后预测中的价值。检验水准(α)为0.05。
2、结 果
2.1 生物信息学分析
差异表达基因分析结果表明,与正常肾脏组织相比,TPT1在RCC组织中表达上调(P<0.000 1,log2(FC)为5 438.821,图1)。京都基因与基因组百科全书通路富集分析结果显示,TPT1在MAPK信号通路和神经活性配体-受体相互作用中显著富集。基因本体功能富集分析结果表明,TPT1在小分子分解代谢过程中显著富集。
图1微阵列数据集GSE15641中RCC与正常肾脏组织的差异表达基因分析
2.2 TPT1在RCC组织中的表达及其与RCC患者临床病理特征的关系
对南通大学附属医院的90例RCC患者组织样本的qPCR检测结果显示,与癌旁正常组织相比,RCC组织中TPT1mRNA表达增高(P<0.01,图2A)。蛋白质印迹法检测结果显示,TPT1在RCC组织中的表达量为1.474±0.094,在癌旁正常组织中的表达量为0.910±0.088,差异有统计学意义(P<0.01,图2B)。根据TPT1蛋白表达平均值将RCC患者分为TPT1高表达(TPT1蛋白表达水平≥1.474,39例)与低表达(<1.474,51例)组,采用χ2检验分析TPT1表达与RCC患者临床病理特征的关系,结果显示,TPT1表达水平与RCC患者年龄、性别、肿瘤分化程度无关,但TPT1表达水平低的RCC患者肿瘤大小及转移发生率均低于TPT1表达水平高的患者(P=0.048、0.017)。见表1。
2.3 TPT1在RCC诊断及预后中的价值
对TCGA数据库中522例RCC患者的临床信息及TPT1表达情况进行ROC曲线分析,结果显示,TPT1对RCC具有较高的诊断价值(AUC=0.856 9,95%CI0.804 5~0.909 3,P<0.001,图3A)。采用Kaplan-Meier生存曲线分析TPT1在RCC中的预后价值,结果表明低TPT1表达组RCC患者的总生存期长于高TPT1表达组(P=0.018 4,图3B)。
图2TPT1在RCC组织中的表达情况
表1不同TPT1表达水平RCC患者的临床病理特征分析
图3 TPT1在RCC诊断及预后评估中的价值
2.4 TPT1在RCC细胞中表达上调
qPCR检测结果显示,与HEK293相比,RCC细胞株769-P、786-O、ACHN和Caki-1细胞中TPT1mRNA的表达均上调(P<0.05或P<0.01),见图4。
2.5 TPT1 siRNA转染效率的验证
qPCR检测结果显示,空白对照组和siRNA NC组HEK293细胞中TPT1mRNA表达差异无统计学意义(P>0.05);与siRNA NC组相比,HEK293细胞转染TPT1 siRNA-1和TPT1 siRNA-2后TPT1mRNA表达均下调(P<0.05或P<0.01,图5A),说明TPT1 siRNA-1和TPT1 siRNA-2均转染成功。两者相比TPT1 siRNA-2对TPT1表达的干扰效果更好,因此选择TPT1 siRNA-2进行后续实验。与siRNA NC组相比,将TPT1 siRNA-2转染到786-O和Caki-1细胞后TPT1mRNA表达量分别降低(64.89±6.14)%、(63.90±5.41)%,差异均有统计学意义(P均<0.01)。蛋白质印迹法检测结果显示,TPT1 siRNA-2和siRNA NC组786-O细胞中TPT1蛋白的表达量分别为0.835±0.038和1.032±0.004,Caki-1细胞中TPT1蛋白的表达量分别为1.190±0.040和1.461±0.031,差异均有统计学意义(均P<0.01,图5B)。
图4 TPT1在正常人胚肾细胞HEK293和RCC细胞(769-P、786-O、ACHN和Caki-1)中的表达
图5 TPT1干扰效率验证结果
2.6 TPT1对RCC细胞增殖的影响
CCK-8实验结果显示,与siRNA NC组相比,在TPT1 siRNA-2转染48 h和72 h后786-O和Caki-1细胞的增殖活力均降低(均P<0.01,图6),表明抑制TPT1表达能降低RCC细胞的增殖能力。
图6 CCK-8法分析TPT1对RCC细胞786-O(A)和Caki-1(B)增殖活力的影响
2.7 TPT1对RCC细胞迁移的影响
划痕实验结果显示,siRNA NC组786-O细胞在24 h后划痕面积缩小到原来的(26.52±1.98)%,TPT1 siRNA-2组划痕面积缩小到原来的(55.41±0.29)%;siRNA NC组Caki-1细胞在24 h后划痕面积缩小到原来的(56.72±5.28)%,TPT1 siRNA-2组划痕面积缩小到原来的(72.81±0.39)%。与siRNA NC组相比,转染TPT1 siRNA-2后786-O及Caki-1细胞的迁移能力均降低(P均<0.01)。见图7。
2.8 TPT1对RCC细胞侵袭的影响
Transwell实验结果显示,TPT1 siRNA-2组786-O细胞的侵袭细胞数为(114±5)个,少于siRNA NC组的(417±4)个(P<0.01);TPT1 siRNA-2组Caki-1细胞的侵袭细胞数为(99±4)个,少于siRNA NC组的(412±3)个(P<0.01),表明转染TPT1 siRNA-2后786-O及Caki-1细胞的侵袭能力均降低。见图8。
2.9 TPT1对RCC细胞中凋亡相关蛋白表达的影响
蛋白质印迹法检测结果显示,siRNA NC组786-O细胞Bcl-2、Bax、MMP9的表达量分别为0.998±0.002、0.402±0.019和1.339±0.054,TPT1 siRNA-2组分别为0.923±0.028、0.678±0.016和0.795±0.015;siRNA NC组Caki-1细胞Bcl-2、Bax、MMP9的表达量分别为1.230±0.044、0.288±0.014和0.842±0.022,TPT1 siRNA-2组分别为0.952±0.017、1.043±0.006和0.663±0.026。与siRNA NC组相比,转染TPT1 siRNA-2后786-O及Caki-1细胞中Bcl-2、MMP9蛋白表达均降低,而Bax蛋白表达均增加(P<0.05或P<0.01),说明抑制TPT1表达能增强RCC细胞的凋亡能力。见图9。
图7 划痕实验验证抑制TPT1表达后RCC细胞786-O(A)及Caki-1(B)迁移能力的变化(200×)
图8 Transwell实验验证TPT1对RCC细胞7 8 6-O及Caki-1侵袭能力的影响(200×)
3、讨 论
图9蛋白质印迹法检测抑制TPT1表达后RCC细胞786-O和Caki-1中的Bcl-2、Bax、MMP9蛋白表达情况
RCC的病因包括遗传改变、染色体不稳定性及生长因子通路激活等[1]。为了明确TPT1在RCC中的病理作用,本研究评估了TPT1在RCC组织和细胞中的表达情况。本研究结果显示在RCC组织中TPT1表达上调,TPT1表达水平低的RCC患者总生存期比TPT1表达水平高的RCC患者长,而且肿瘤大小和转移发生率均低于TPT1表达水平高的患者,说明TPT1可能在RCC中发挥促肿瘤作用。
本研究结果与以往在多种肿瘤中的研究结果一致,即TPT1表现为促肿瘤基因,如Sun等[17]报道TPT1在结直肠癌中能够促进肿瘤细胞增殖和细胞分裂,Zhu等[18]研究报道TPT1表达增强与宫颈癌进展相关。本研究结果显示,TPT1在RCC组织和细胞中表达上调,干扰TPT1表达可抑制RCC细胞的体外增殖、迁移和侵袭,并增强其凋亡,表明TPT1可能是RCC潜在的治疗靶点。
文章来源:王庆卿,黄新忠,胡崟钰,等.翻译控制肿瘤蛋白1调控肾细胞癌细胞增殖迁移的机制[J].海军军医大学学报,2024,45(12):1521-1528.
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约有30%的肾癌患者为转移性肿瘤,该类患者放、化疗治疗效果不佳,预后较差,5年生存率低于10%[2⁃3]。近年来,针对转移性肾癌的细胞因子、靶向及免疫等多种疗法取得极大进展,多样化的治疗方法使得转移性肾癌患者的无进展生存期和总生存期得以延长,其中外科手术和靶向药物的联合疗法被认为是目前最有效的治疗手段[4⁃5]。
2025-08-25临床治疗不仅旨在清除肿瘤,还需兼顾肾脏功能的保留,治疗策略的选择对患者长期生活质量及预后具有深远影响。手术是当前治疗肾细胞癌最有效的方法。根治性肾切除术是传统手术治疗方法。该手术可通过完全切除受累肾脏,达到根治的目的[2]。
2025-08-14在实际临床应用中,通常将P504S阴性和P504S阳性肾肿瘤患者统一考虑并治疗,但随着临床研究的深入,这2种人群肿瘤的侵袭性和预后都有显著差异[3]。P504S阴性患者可采用肾癌常用的靶向药物进行治疗,从而控制病情的发展,但阳性患者存在AMACER靶点,因此其可从靶向药物中获益更多[9]。
2025-07-24肾癌是泌尿系统的三大恶性肿瘤之一。老年人群为该病的高发群体,该类患者大多存在肾癌以外的麻醉以及手术高危因素,可导致围手术期并发症发生率和死亡风险显著升高,因此老年肾癌患者围术期麻醉方案的优化具有重要临床意义。目前后腹腔镜下肾癌根治术已经成为临床治疗肾癌的首选手术方式,相比于开放手术,其更能提高患者的生存率和生活质量。
2025-06-24微小RNA(miRNA)在真核细胞中广泛存在,其具有表达时序性、组织特异性和高度保守性的特点[4]。miRNA经过转录后可影响下游基因表达,对细胞分化、增殖和发育等生物学过程有调控作用,在肿瘤、心血管疾病和免疫疾病等多种疾病中发挥着重要作用[5,6]。
2025-05-28肾癌是起源于肾脏组织的疾病,手术治疗是首选治疗方式。作为局限性肾癌治疗的标准术式,根治术治疗对局限性或无明确转移者具有良好效果,但其容易对肾脏组织造成一定程度的损伤,引发急性肾损伤(acutekidneyinjury,AKI)。既往研究显示,AKI可导致患者死亡率增加,因此早识别早干预对降低患者术后透析率、改善预后具有重要意义。
2025-04-25肾母细胞瘤是儿童年龄段最常见的肾癌,其标准化治疗包括手术和化疗相结合,高危患者加放疗,预后通常良好,然而,晚期肿瘤患儿的结局仍然很差。 因此对肾母细胞瘤发病机制进行全面研究,对开发新的治疗药物具有重要意义。 青蒿琥酯( artesunate,Art) 是从中药青蒿中提取的一种水溶性衍生物,具有抗肿瘤活性。
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2025-02-24肾癌发病与希佩尔-林道(vonHippel-Lindau,VHL)基因密切相关[3-4]。MRI为诊断肾癌的常用影像学方法[5],T2WI通过组织中水分子T2弛豫时间反映其内水分子运动状态,进而提供病灶内部结构信息,对判断肾癌分型具有重要价值[6]。本研究观察MRT2WI瘤内及瘤周影像组学预测肾癌VHL基因突变的价值。
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期刊名称:肿瘤学杂志
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主管单位:浙江省卫生和计划生育委员会
主办单位:浙江省肿瘤医院,浙江省抗癌协会
出版地方:浙江
专业分类:医学
国际刊号:1671-170X
国内刊号:33-1266/R
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创刊时间:1977年
发行周期:月刊
期刊开本:大16开
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