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2017—2022年北京市西城区聚集性腹泻疫情病毒检测结果分析

2024-11-22 38 上传者：管理员

摘要：目的分析2017—2022年北京市西城区聚集性腹泻疫情流行特征和病原体变化，为制定疫情防控政策提供依据。方法收集2017年1月至2022年12月北京市西城区聚集性腹泻疫情患者便标本，同时采集部分单位厨师便标本，使用荧光定量PCR检测轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒及腺病毒。对于诺如病毒阳性标本，使用RT-PCR扩增ORF1/ORF2区核酸片段，测定序列并分型。结果 2017—2022年北京市西城区报告401起聚集性腹泻疫情，幼儿园、小学及中学报告369起，占比92.02%,每千人患病人数分别是4.14、2.13、0.69人；15起疫情中74名厨师检出诺如病毒阳性，阳性率为8.67%;按病原体看，诺如病毒引起疫情占比最多，呈逐年下降趋势，且每年至少有3种GⅡ亚型诺如病毒检出。结论幼儿园及中小学是北京市西城区腹泻疫情发生主要场所；未明原因引起腹泻疫情呈上升趋势，应及更新检测方法，扩大病原体监测种类范围；北京地区诺如病毒流行呈“多亚型并存，亚型间交替出现”的状况。新亚型的引入或已有亚型间的重组需引起密切关注。

关键词：
亚型
患病率
聚集性腹泻
诺如病毒
阳性率
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感染性腹泻易感人群分布广泛，免疫力维持时间短，是世界各国面对的重大公共卫生问题之一[1],也是我国儿童患病和死亡的重要原因[2]。由其引起的聚集疫情常年居于我国传染病监测系统报告疫情种类的前列[3],是传染病管理重点关注工作之一。感染性腹泻病原体包括病毒、细菌、寄生虫等多种微生物。北京及上海地区病毒感染率大于细菌[4-5],常见病毒包括诺如病毒、轮状病毒、札如病毒、腺病毒、A组双埃可病毒、博卡病毒等[6]。其中，诺如病毒是中小学及养老机构聚集性腹泻疫情的最主要病原体[7-8]。引起疫情的诺如病毒主要是GI、GⅡ型，二者可以进一步分为30多个型。报道发现，不同亚型GⅡ型诺如病毒的交替出现往往会引起聚集性腹泻疫情的快速升高：2014年GII.17 [P17]出现使腹泻患者比往年增长了35.6%[9];2016—2017年冬季，GII.2 [P16]的再次出现使多个国家腹泻疫情迅速上升[10]。

该研究总结了2017—2022年北京市西城区感染性腹泻疫情发病率及病原谱变化情况，期望能为后续开展感染性腹泻疫情防控与管理工作提供背景资料和决策依据。

1、对象与方法

1.1病例及疫情定义

1.1.1急性胃肠炎临床诊断病例

依据《诺如病毒感染暴发调查和预防控制技术指南(2015版)》[11],以呕吐或腹泻等消化道症状为主诉就诊，24 h内腹泻大便次数≥3次，粪便性状异常(稀便、水样便、粘液便或脓血便等)患者。

1.1.2聚集性腹泻疫情定义

依据《北京市痢疾及其它感染性腹泻监测和疫情处置工作方案(2016版)》[12],3d内，同一集体单位或场所，发生3例及以上急性胃肠炎临床诊断病例。

1.1.3聚集性腹泻疫情定性

同一起聚集性腹泻疫情，有两例或两例以上患者检出同一种腹泻病原体，该疫情定性为由检出病原体感染所致[11-12]。

1.2标本及资料收集

采集患者新鲜粪便5g置于无菌塑料便盒中，4℃保存。若同一单位多个班级或部门出现病例且含自建食堂者，同时采集该单位全部厨师便标本。标本送检填写疫情采样送检表，24h内送实验室检测，同时收集临床和流行病学资料。

北京市西城区2017—2022年在校学生及其他社会机构相关数据源自北京市西城区国民经济和社会发展统计公报[13]。

1.3检测方法

1.3.1病毒核酸提取与多重荧光定量

PCR检测使用PBS制备10%便标本混悬液，10 000 rpm离心2min,吸取上清液140μL,使用QIAGEN公司QIAamp Viral RNA Mini Kit试剂盒按照说明书提取RNA,80μL洗脱提取产物。使用卓诚惠生生物科技有限公司试剂盒，采用Real-time PCR方法，同时检测轮状病毒、诺如病毒、札如病毒、星状病毒及腺病毒。

1.3.2诺如病毒分型

收集诺如病毒阳性核酸，选择CT值<25者，采用RT-PCR方法扩增ORF1/ORF2区片段[9],扩增产物送诺赛基因测序，序列编辑后提交http: //www.rivm.nl/mpf/norovirus/typingtool网站分型[14]。

2、结果

2.1基本情况

2017—2022年，北京市西城区报告401起聚集性腹泻疫情。2021年最多，报告118起。其他年份波动较小，平均每年报告56.60起。疫情共报告腹泻病例2 309人，病毒检测阳性1 273人，阳性率为55.13%。其中，诺如病毒阳性1 000人，占78.55%;札如病毒154人，占比12.10%;腺病毒26人，占比2.04%;星状病毒20人，占比1.57%;轮状病毒11人，占比0.86%;检出两种或三种病毒混合阳性标本62人，占比4.87%。有37起诺如病毒疫情采集厨师便标本854件，15起疫情中74名厨师检出阳性，阳性率为8.67%。

2.2聚集性腹泻

疫情分布与患病率401起聚集性腹泻疫情中，幼儿园、小学、中学(含初中与高中，下同)共报告369起，占比92.02%;医疗机构8起，老龄养老公寓4起，家庭聚集性疫情4起，公司与企事业单位(不含医疗机构与老龄公寓)报告16起。

依据2017—2022年北京市西城区国民经济和社会发展统计公报每年学校及在校学生数，幼儿园、小学、中学每校每年平均分别发生0.19、0.66、0.18起聚集性腹泻疫情，每年每千人有4.14、2.13、0.69人感染，每起疫情平均感染5.05、5.50、4.14人(表1)。

2.3聚集性腹泻疫情病因分布情况

401起聚集性腹泻疫情中，诺如及诺如混合其他病毒224起，占比55.86%,其他病毒50起，占比12.47%;未明原因(未检出诺如病毒，轮状病毒，札如病毒、星状病毒及腺病毒，下同)127起，占比31.67%。分年份看，诺如及诺如混合其他腹泻病毒引起的疫情数量占比逐年减少，由2017年88.24%减少至2022年38.24%。由札如病毒和未明原因引起的腹泻疫情总体呈上升趋势，尤其是未明原因引起的聚集性腹泻疫情，2022年占比达35.29%(表2)。

2.4诺如病毒基因分型与序列分析

诺如及诺如混合其他病毒疫情224起，包括：GI32起，GII186起，GI与GII混合6起。共1 000例标本诺如病毒检测阳性，其中，GI阳性142例，GII阳性840例，GI与GII混合阳性18例。

6起GI与GII混合感染疫情未确定亚型。有83起GII型诺如病毒疫情确定亚型，检出亚型种类包括：GII.2 [P16],GII.17 [P17],GII.4 [P31],GII.6 [P7],GII.3 [P12],GII.15 [P15],GII.4 [P16],GII.8 [P8],同起疫情中未发现两种或两种以上亚型混合感染。2017—2021年，北京市西城区每年至少检出3种或3种以上亚型。GII.2 [P16]长期处于主导优势，但检出占比由88.89%下降至31.58%,呈逐年下降趋势。GII.17 [P17]与GII.4 [P31]长期存在于低位流行状态。GII.6 [P7]与GII.4 [P16]分别于2018、2019年检出后，每年都有其引起的聚集性腹泻疫情出现(图1)。

15起GI型诺如病毒疫情确定型别，检出亚型有三种：GI.6[P11](10起),GI.5[P4](10起),GI.3[P13](5起),同起疫情中未发现两种或两种以上亚型混合感染。

表12017—2022年西城区聚集性腹泻疫情场所分布情况

表22017—2022年西城区聚集性腹泻疫情病因分布情况

图12017—2021年西城区GII型诺如病毒疫情亚型类别分布

3、讨论

研究首次给出了北京市城区幼儿园与中小学腹泻疫情每千人患病率，为制定区域卫生政策和传染病防控策略提供了数据依据。幼儿园、小学、中学每千人患病人数分别是4.14、2.13、0.69人，每千人患病人数逐渐降低，显示随着学生年龄增长，卫生习惯的逐渐养成，患病率逐渐下降。每年每校平均腹泻疫情报告数小学>幼儿园>中学，小学疫情数高于幼儿园可能与在校学生基数高及学生活动范围大等因素有关。与国内其他城市报道一致[15-17],幼儿园及中小学也是北京市西城区腹泻疫情发生主要场所(多数年份占比>90%)。其原因除学校人员聚集，易发生疫情外；可能还与疫情报告制度落实较好，学校疫情监测敏感度高有关；也与学龄儿童和青少年的免疫能力相对较低有关。

2017—2022年北京西城区报告8起医疗机构，4起养老机构聚集性腹泻疫情，据报道，美国超过60%的诺如病毒暴发主要发生医院与养老机构[18]。有理由推测，随着我国社会日趋老龄化，医院与养老机构腹泻疫情发生比例将会逐渐增多。因此，基层传染病防控工作有必要提前布局，完善医院及养老机构疫情监测及报告制度，提高疫情处置效率。

常见腹泻病原体有病毒、细菌、寄生虫三类。受经济卫生发展、气候条件、地理状况影响，不同地区感染性腹泻患病率和病原体构成差异较大[19]。2017—2022年北京市西城区由未明原因引起的腹泻疫情总体呈上升趋势，腹泻疫情处置中有必要加强细菌与寄生虫监测。然而，由于检测标准与方法的滞后，开展细菌及寄生虫检测面临一定困难。

依照国家标准，病原菌检测以分离培养及表型鉴定为主，分离培养虽然是“金标准”,但检测周期长，敏感性低，目前亟需探索建立病原菌核酸标准，提高检测敏感性[20]。

寄生虫不仅引起动物感染，也是一类人畜共患病。西城区于2013年在医务人员中开展的一项调查显示，30%的被调查者喂养宠物，狗或猫者占喂养宠物的50%以上[21]。上海市某宠物医院调查显示，20%就诊犬、猫可检出隐孢子虫或贾第虫[22 ]。有业内专家已经关注到目前寄生虫病诊疗中的困难，于2023年10月发布了《食源性寄生虫病诊治专家共识(2023)》,以期提高医疗机构对食源性寄生虫的综合诊治能力。然而，目前寄生虫检测仍以镜检与免疫方法为主，这两种方法受到敏感性、特异性或操作便捷性的限制，有必要探索建立分子生物学方法标准开展寄生虫检测[23]。

诺如病毒是腹泻疫情的最重要病原体，患者排毒可以长达数月或数年。由于症状不明显，隐性感染者排毒在疾病传播中作用更大[24-25]。研究发现疫情发生单位内厨师便标本诺如病毒阳性率为8.67%,明显高于同地区非疫情餐饮单位厨师诺如病毒携带率(3.00%)[26],是国内首次报道相关比较数据，提示厨师感染诺如病毒可能是单位发生聚集性腹泻疫情的危险因素之一。因此，腹泻疫情流行季，应加强厨师及食堂工作人员的健康监测与管理。

研究还分析了2017—2021年北京市西城区诺如病毒的亚型变化情况。有83起诺如病毒疫情确定型别，每年至少检出3种基因亚型，2021年检出亚型最多，共8种基因亚型。2017—2019年，以GⅡ.P16-GⅡ.2为优势亚型，该亚型在后续年份比例降低，2018年后相继检出GⅡ.P7-GⅡ.6,GⅡ.P16-GⅡ.4,GⅡ.P8-GⅡ.8与GⅡ.P12-GⅡ.3。结合文献报道，北京市丰台区在2014年的8起诺如疫情中检测到6种不同GⅡ型诺如病毒亚型[27],说明北京地区诺如病毒流行呈现“多亚型并存，亚型间交替出现”的状况。新亚型的引入，或已有亚型间的重组会否引起聚集性腹泻疫情的快速升高需引起密切关注。

利益冲突所有作者均声明不存在利益冲突

参考文献:

[2]武颂文,石一,栾阳,等.1990—2019年中国感染性腹泻疾病负担分析及模型预测[J].现代预防医学,2023,50(21):3871-3877.

[4]方辉,陈丽青,张悦,等.2018—2020年上海市闵行区腹泻病监测结果分析[J].公共卫生与预防医学,2024,35(1):79-82.

[5]吉彥莉,王永全,崔海洋,等.2015—2018年北京市西城区5岁以下儿童病毒性腹泻流行病学特征[J].公共卫生与预防医学,2020,31(3):104-107.

[6]吉彥莉,王永全,崔海洋,等.北京市急性腹泻患儿中A组双埃可病毒的感染状况及基因型研究[J].公共卫生与预防医学,2023,34(6):21-25.

文章来源:崔海洋,吉彥莉,靳博,等.2017—2022年北京市西城区聚集性腹泻疫情病毒检测结果分析[J].公共卫生与预防医学,2024,35(06):72-76.